Den unge amerikaner Mitch Rapp (Dylan O'Brien) mister sin forlovede under en ferie på grund af et terrorangreb. Fuld af hævnlyst lader han sig hverve til CIAs hemmelige agentprogram, der er ledet af koldkrigsveteranen Stan Hurley (Michael Keaton). Parret bliver sat til at undersøge en række angreb, der har fundet sted på militære og civile mål. Sporet fører dem til den skruppelløse terrorist Ghost (Taylor Kitsch), som ønsker at starte en krig i Mellemøsten med 15 kg stjålet plutonium.
En ganske særlig flyafgang med nogle af USA's farligste forbrydere ombord kapres på vejen til et nyt og absolut flugtsikkert fængsel. Heldigvis er også et enkelt anstændigt menneske med blandt de hårdhudede passagerer, og Cameron Poe (Nicolas Cage), som står foran sin løsladelse efter at have afsonet otte år for at dræbe en mand, der chikanerede hans gravide hustru, er klar til at tage kampen op imod kaprerne og deres psykopatiske leder Cyrus Grissom (John Malkovich).
Da Emma (Alexandra Daddario) tror, at det fly hun er ombord på, vil styrte ned, begynder hun at betro alle sine hemmeligheder til den charmerende fyr (Tyler Hoechlin), som hun sidder ved siden af. Men flyet styrter ikke ned, og dagen efter opdager hun, at manden ejer det firma, som hun arbejder for. Hvad gør hun nu? En film med Alexandra Daddario fra ’Batwatch’ og tv-serien ’White Lotus’.